变速箱出现故障的原因有多种，主要包括以下几个方面：

1. 齿轮本身精度等级达不到要求或者在加工过程中出现问题导致变速箱出现故障。此外，变速箱内部的轴承滚针和轴承滚道由于长时间运转会产生磨损，这也是导致变速箱故障的常见原因之一。轴承长期使用而产生的老化以及耐磨程度会降低变速箱整体的效率并带来动力流失的故障现象。一旦齿轮间隙过大形成跳档，会给变速箱带来强烈的冲击，造成变速箱壳体破裂或内部零件损坏等问题。

2. 操作不当导致变速箱出现故障。自动挡汽车由于操作不当导致变速箱损坏的情况并不少见。例如长时间使用离合没有彻底分离或使用不规范的刹车挡等行为会给变速箱内部的离合装置造成严重损耗并使其发热进而影响其功能运作。另外，变速箱进水也会导致变速箱内部零件生锈腐蚀，从而影响其功能发挥甚至报废。尤其是在涉水路面行驶时，变速箱容易进水。在驾驶过程中，应尽量避免长时间低速行驶和频繁使用低速挡，以免加剧变速箱齿轮的摩擦并导致过热损坏等状况。发动机的温度也很容易升高并对内部的密封零件造成影响进而出现故障现象，同时高油液温度也会对变速箱造成更大的冲击损害其正常运转功能。一旦车辆的齿轮咬得过紧或者是齿面有损伤等都会造成变速箱出现故障问题。

综上所述，变速箱故障的原因可能涉及到设计、制造、操作等多个方面。因此，在使用中应注意规范操作并定期检查维护变速箱，以确保其正常运行并延长使用寿命。如果出现故障应及时排查原因并进行维修或更换相关部件。